Bienvenid@s

Los proyectos en el Lab se enfocan a investigar la variación morfológica y la descripción cuantitativa de la forma
Artículo de divulgación "Morfometría: de las palabras, a las figuras ... y a los números para medir la forma". Aqui>

En este Laboratorio se capturan y editan imágenes digitales. Las imágenes se procesan con programas de morfometría para registrar mediciones lineales entre pares de puntos o las coordenadas Cartesianas "x,y" de conjuntos de puntos. 


Esta información numérica de la variación de las formas se analiza estadísticamente. Los datos morfométricos se usan para ayudar en la reconstrucción de filogenias, para análisis ecológicos de forma-función, y/o para otras aplicaciones en biologia.

Imágenes. El laboratorio cuenta con cámaras para fotografía digital, stand vertical con sistema de iluminación para fotografía, monitores de alta definición, microscopios compuestos y estereoscópicos y equipo de cómputo para el procesamiento de imágenes y los análisis morfométricos.


La combinación de cámaras, lentes, adaptadores para tubo C y T de microscopios cubre una amplia escala de organismos desde los microscópicos hasta especímenes en la escala de varios centímetros.


Aquí pueden ver algunos ejemplos de fotografías de los organismos estudiados y los protocolos para el registro de puntos.

El registro de las coordenadas Cartesianas "x, y" de los siete puntos azules sobre la fotografía del ala produce una colección de catorce números, la cual describe numéricamente la forma y el tamaño.
Morfometría. Morfometría es el estudio de la forma y tamaño mediante el uso de descriptores cuantitativos.
Incluye las técnicas para el registro numérico de la morfología mediante
  • mediciones lineales entre puntos, (por ejemplo, x mm, el ancho de una estructura), o
  • coordenadas Cartesianas de los puntos (por ejemplo, "x, y" del punto uno; "x, y" del punto dos)
El registro de las coordenadas Cartesianas de los puntos anatómicos (marcas y semi-marcas) lo realizamos con los programas tpsUtils y tpsDig.


En el Lab empleamos varias técnicas de morfometría con mediciones lineales (morfometría tradicional) y con configuraciones de coordenadas x,y de marcas y semi-marcas (morfometría geométrica). Estos números permiten la aplicación de métodos matemáticos y estadísticos para el análisis de la variación en la forma y el tamaño.


Estadística. La variación en las mediciones o coordenadas se analiza con técnicas estadísticas univariadas y multivariadas. Por ejemplo, Análisis de Componentes Principales (PCA) para ordenar la variación, Análisis de Variables Canónicas (CVA) para análisis multivariados de la varianza por grupos y análisis de Regresión para explorar la asociación entre dos variables, usualmente la forma y el tamaño o la forma y la función.

Cuando los datos numéricos consisten en mediciones lineales entre marcas, la variación puede ser directamente analizada con métodos estadísticos regulares de la estadística multivariada. Uno de los programas con los que realizamos los análisis (PCA, CVA) es Statistica.

Pero cuando los datos son las configuraciones de coordenadas "x,y", éstas primero se ajustan y transforman mediante la aplicación de métodos se superposición para remover los efectos de ubicación, orientación y tamaño.


Operaciones algebraicas con las coordenadas superpuestas (eigenanalisis) generan nuevas variables de deformación relativa respecto a una forma promedio (partial warps). Estos análisis de la variación de las coordenadas se realizan con los métodos estadísticos especiales de la morfometría geométrica multivariada. En este caso, usamos un conjunto de programas en el paquete Integrated Morphometrics Package (IMP) y tambien programas de la serie TPS.

Filogenia. La interpretación de la variación morfométrica (sean mediciones o coordenadas) se relaciona con factores históricos, especialmente para la reconstrucción de la filogenia (morfometría filogenética). Para estos análisis filogenéticos usamos TNT. Un ejemplo reciente del análisis filogenético de configuraciones de marcas de la forma esta aquí >>>



Ecomorfología. También se interpreta la variación de la forma en el contexto de factores ecológicos, particularmente explorando los procesos de la relación forma-función. La variedad de análisis estadisticos para este tipo de hipótesis se examinan con programas en el paquete IMP y TPS. Un ejemplo reciente exploró la relación entre la forma del cráneo y la dieta en especies de Myotis.


Morfometría y sistemática. 
 En este artículo de revisión, se presentan conceptos básicos de la teoría de la morfometría, geometría vectorial, el espacio de Kendall, la distancia Procrustes, proyección de espacios tangenciales y construcción de hipercubos del morfoespacio. Se revisan conceptos y métodos estadísticos útiles para la aplicación de los Análisis de Componentes Principales y los Análisis de Variables Canónicas en sistemática. Particularmente se dan recomendaciones y ejemplos sobre el uso de mediciones lineales y coordenadas de puntos en análisis morfométricos para la identificación de especies, la variación de caracteres taxonómicos y en la inferencia de filogenias y clasificación.
De Luna, E. 2020. Integrando análisis morfométricos y filogenéticos: de la sistemática fenética a la morfometría filogenética. ACTA BOTANICA MEXICANA 127: e1640.
Descargar el archivo PDF


1 comentario:

  1. Excelente laboratorio e integrantes.

    P.D. Me gusto la foto

    Saludos

    M.C. Jorge Chollet

    ResponderBorrar